ワゴンRの上位モデル「ワゴンR スティングレー」に設定された350万台記念特別仕様車『ワゴンR スティングレー リミテッド』は、ノンターボ車「X」グレードをベースに精悍さを高めたモデル。外装では、スケルトンタイプのブラックメッキフロントグリルやブラックメッキヘッドランプ、ガンメタリック塗装の新形状14インチアルミホイールなどを採用し、さらにLEDサイドターンランプ付ドアミラーを装備する。また外装イメージにマッチした特別設定色「バタフライバイオレットメタリック(紫色)」を加えた全6色のボディカラーを用意する。
　内装もインパネ・フロントドアトリム・フロントスピーカーに青色LEDのイルミネーションを採用したほか、専用シート表皮やオートライトシステムを装備する。またバックモニター付CDプレーヤーをメーカーオプション設定とした。
　特別仕様車「スズキ ワゴンR スティングレー リミテッド」の価格は、1,265,250円[4速AT：2WD]から1,296,750円/1,414,350円[CVT：2WD/4WD](消費税込み)まで。ベースモデルに対しわずか10,500円高の設定となる。こちらもCVT車は2WD/4WDともにエコカー減税75%に、4速AT車[2WD]はエコカー減税50%にそれぞれ適合する。